Bàn Tranh là công chúa út của vương quốc Champa, vì trái lệnh vua cha nên bị thả xuống thuyền lưu đày biệt xứ đến đảo Phú Quý. Đền thờ do người Chăm xây dựng vào cuối thế kỷ XV - đầu thế kỷ XVI để thờ công chúa Bàn Tranh, người có công đưa các giống cây lương thực, hoa màu và hướng dẫn người dân trên đảo khai khẩn đất đai làm ruộng vườn, hình thành xóm làng và chỉ dạy người dân cách trồng trọt, làm nghề. Bà là người tài đức, đạo hạnh, được nhân dân tôn sùng làm Chúa đảo hay Bà Chúa Xứ.
Đền thờ đã bị sụp đổ nhiều lần. Mỗi lần sụp đổ là một lần nhân dân trong các làng trên đảo đóng góp công sức và vật liệu để sửa sang lại. Tuy nhiên sau nhiều lần tu sửa trong tình trạng “tam sao thất bản” nên ngôi đền không còn giữ được nguyên trạng như xưa. Mộ và giếng nước cổ của người Chăm cũng được lưu giữ tại khu đền thờ này.