Bảo tàng Địa chất là nơi lưu giữ các mẫu vật địa chất - khoáng sản. Bảo tàng chuyên ngành này lưu giữ và trưng bày hơn 20.000 mẫu đá, các lõi khoan, 50 sưu tập mẫu cổ sinh vật, nhiều sưu tập mẫu khoáng sản của các mỏ điển hình của Việt Nam cùng nhiều sưu tập mẫu khoáng vật của các nơi trên thế giới.
